1.高壓蒸汽滅菌 
    為濕熱滅菌方法的一種。是微生物培養中最重要的滅菌方法。這種滅菌方法是基于水在煮沸時所形成的蒸汽不能擴散到外面去，而聚集在密封的容器中，在密閉的情況下，隨著水的煮沸，蒸汽壓力升高，溫度也相應增高。(PV=nRT) 高壓蒸汽是最有效的滅菌法，能迅速地達到完全徹底滅菌。一般在15磅/英寸2壓力下（121.6℃），15～30分鐘，所有微生物包括芽孢在內都可殺死。它適用于對一般培養基和玻璃器皿的滅菌。 
    進行高壓蒸汽滅菌的容器是高壓蒸汽滅菌鍋。高壓蒸汽滅菌鍋是一個能耐壓又可以密閉的金屬鍋，有立式與臥式兩種。  
    可以用電熱、煤氣、蒸汽等。鍋上裝有壓力表，有的還裝有溫度計，能及時了解鍋內壓力及溫度。鍋上還設有排氣口，其作用是在密閉之前，利用蒸汽將鍋內的冷空氣排凈，另外還裝有安全活門，如果壓力超過一定限度，活門即可自動打開，放出過多的蒸汽。 
2.干熱滅菌 
    微生物培養中常用的干熱滅菌是指熱空氣滅菌。一般在電烘箱中進行。干熱滅菌所需溫度較濕熱滅菌高，時間也較濕熱滅菌長。這是因為蛋白質在干燥無水的情況下不容易凝固。一般須在160℃左右保持恒溫3～4小時，方能達到滅菌的目的。 
    干熱滅菌適用于空玻璃器皿的滅菌，凡帶有橡膠的物品和培養基，都不能進行干熱滅菌。 
3.間歇滅菌 
    各種微生物的營養體在100℃溫度下半小時即可被殺死。而其芽孢和孢子在這種條件下卻不會失去生活力。間歇滅菌就是根據這一原理進行的。 
    間歇滅菌的方法是用100℃、30分鐘殺死培養基內雜菌的營養體，然后將這種含有芽孢和孢子的培養基在溫箱內或室溫下放置24小時，使芽孢和孢子萌發成為營養體。這時再以100℃處理半小時，再放置24小時。如此連續滅菌3次，即可達到完全滅菌的目的。 
    間歇滅菌通常在流動蒸汽的滅菌鍋中進行，也可用普通鋁鍋代替。這種滅菌方法多用于明膠、牛乳等物質的滅菌，這類物質在100℃以上的溫度下處理較長時間，會被破壞，而用間歇滅菌法就既起到了殺菌作用，又使被處理的物質免遭破壞。 
4.紫外線滅菌

    紫外線殺菌力最強的是波長2650～2660Å(10-1nm)的部分。無菌室緩沖間和接種箱常用紫外線燈作空氣滅菌。無菌室和緩沖間的照射時間為20～50分鐘（視房間大小而定），接種箱照射10～15分鐘即可。 
    為了加強紫外線滅菌的效果，在照射前，可在無菌室、緩沖間或接種箱內噴灑5%石炭酸，以使空氣中附著有微生物的塵埃降落，同時也可以殺死一部分微生物。無菌室的工作臺的臺面和椅子，可用2～3%的來蘇兒擦洗。然后再照射紫外線。由于紫外線對人體有傷害作用，所以人不要直視正在照射的紫外線燈，也不要在照射情況下進行工作。 
    滅菌后，為了檢驗紫外線的滅菌效果，可以在無菌室、緩沖間或接種箱內放一套盛有培養基的培養皿，將皿蓋打開5～10分鐘，蓋好后，放入溫箱中培養。如果只有一、二個菌落，可認為滅菌效果良好。如雜菌叢生。則需延長照射時間或同時加強其它滅菌措施。